Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps11P62281 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps11P62281 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms