Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Snap25P60879 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snap25P60879 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap25P60879 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms