Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp4P59240 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms