Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Paxbp1P58501 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Paxbp1P58501 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms