Protein–RNA interactions for Protein: P58006

Sesn1, Sestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sesn1P58006 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sesn1P58006 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sesn1P58006 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms