Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtnsP57757 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtnsP57757 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtnsP57757 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms