Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Samsn1P57725 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samsn1P57725 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms