Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctbp2P56546 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctbp2P56546 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms