Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pex2P55098 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms