Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtskP55097 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtskP55097 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtskP55097 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtskP55097 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtskP55097 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms