Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GemP55041 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GemP55041 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GemP55041 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GemP55041 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GemP55041 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GemP55041 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GemP55041 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GemP55041 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GemP55041 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GemP55041 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GemP55041 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GemP55041 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GemP55041 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GemP55041 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GemP55041 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GemP55041 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms