Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PctpP53808 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PctpP53808 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PctpP53808 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PctpP53808 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PctpP53808 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PctpP53808 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PctpP53808 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PctpP53808 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms