Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fgd1P52734 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms