Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ApodP51910 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ApodP51910 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ApodP51910 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ApodP51910 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ApodP51910 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ApodP51910 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ApodP51910 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ApodP51910 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ApodP51910 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ApodP51910 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ApodP51910 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ApodP51910 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ApodP51910 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ApodP51910 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ApodP51910 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ApodP51910 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ApodP51910 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ApodP51910 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms