Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpc4P51655 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpc4P51655 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms