Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SftpbP50405 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SftpbP50405 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms