Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpcP49452 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms