Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GdnfP48540 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GdnfP48540 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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