Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prox1P48437 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prox1P48437 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms