Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VdrP48281 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VdrP48281 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VdrP48281 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VdrP48281 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VdrP48281 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VdrP48281 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VdrP48281 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VdrP48281 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VdrP48281 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VdrP48281 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VdrP48281 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms