Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TgfaP48030 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms