Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nedd4P46935 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4P46935 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms