Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgavP43406 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgavP43406 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms