Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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