Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept1P42209 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept1P42209 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept1P42209 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept1P42209 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept1P42209 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept1P42209 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept1P42209 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sept1P42209 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept1P42209 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept1P42209 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms