Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tac1P41539 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tac1P41539 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tac1P41539 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms