Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syt4P40749 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syt4P40749 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms