Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf2P39429 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms