Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Upk2P38575 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upk2P38575 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms