Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sar1aP36536 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms