Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sftpa1P35242 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms