Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola1P33609 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pola1P33609 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms