Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Notch4P31695 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Notch4P31695 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Notch4P31695 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Notch4P31695 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Notch4P31695 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Notch4P31695 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Notch4P31695 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Notch4P31695 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms