Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou3f3P31361 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou3f3P31361 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms