Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms