Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms