Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd28P31041 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd28P31041 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cd28P31041 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms