Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtgfP29268 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms