Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprmP28828 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprmP28828 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprmP28828 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprmP28828 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprmP28828 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprmP28828 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprmP28828 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprmP28828 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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