Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif5cP28738 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif5cP28738 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif5cP28738 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif5cP28738 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Kif5cP28738 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kif5cP28738 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms