Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgaP26339 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ChgaP26339 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgaP26339 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms