Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcb1aP21447 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcb1aP21447 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms