Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcaP20444 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms