Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TP20293 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TP20293 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TP20293 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TP20293 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TP20293 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TP20293 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TP20293 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TP20293 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms