Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18525 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18525 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18525 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P18525 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18525 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18525 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms