Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18524 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18524 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18524 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18524 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18524 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18524 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18524 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18524 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18524 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18524 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18524 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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