Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmga1P17095 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hmga1P17095 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms