Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra6P16305 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra6P16305 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms