Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf1P15314 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms