Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrgnP13609 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrgnP13609 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms